Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IGLV3-25P01717 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGLV3-25P01717 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms