Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE6O95741 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE6O95741 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CPNE6O95741 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms