Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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GGTLC3B5MD39 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
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GGTLC3B5MD39 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GGTLC3B5MD39 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GGTLC3B5MD39 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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