Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX8Q9Y5X2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX8Q9Y5X2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX8Q9Y5X2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX8Q9Y5X2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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