Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF1Q9UH73 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF1Q9UH73 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms