Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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