Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RNF7Q9UBF6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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RNF7Q9UBF6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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