Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms