Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ABCC13Q9NSE7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms