Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2TQ9NPD8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms