Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SLIRPQ9GZT3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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