Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms