Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
KRTAP2-4Q9BYR9 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms