Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms