Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPN18Q99952 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms