Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PKP4Q99569 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms