Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C8orf49Q96NF6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms