Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SGCZQ96LD1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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