Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM12Q96EX1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms