Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG4Q92954 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms