Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms