Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC112Q8NEF3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms