Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AMER3Q8N944 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms