Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF148Q8N7C7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms