Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SFRP1Q8N474 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SFRP1Q8N474 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms