Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms