Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRT2Q7Z6L0 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms