Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUFY3Q7L099 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms