Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RAB29-202ENST00000367139 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms