Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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