Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HADHQ16836 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHQ16836 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHQ16836 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHQ16836 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HADHQ16836 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms