Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms