Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NTRK2Q16620 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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