Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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BRD3Q15059 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BRD3Q15059 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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