Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNB1Q14721 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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