Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CAMK2DQ13557 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CAMK2DQ13557 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CAMK2DQ13557 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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