Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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