Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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