Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TRIP13-205ENST00000510412 571 ntTSL 512.19□□□□□ -0.467e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TRIP13-202ENST00000508430 306 ntTSL 39.67□□□□□ -0.867e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.577e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.527e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.467e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.397e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-211ENST00000426513 905 ntTSL 316.09■□□□□ 0.177e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.137e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-202ENST00000357186 2011 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.667e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ALG8-218ENST00000532306 844 ntTSL 59.41□□□□□ -0.97e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MPV17-220ENST00000620797 624 ntTSL 39.35□□□□□ -0.917e-16■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.565e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.865e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SNAP29-203ENST00000490458 972 ntTSL 220.19■□□□□ 0.825e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 CKB-211ENST00000555039 270 ntTSL 516.82■□□□□ 0.285e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 CKB-212ENST00000555366 419 ntTSL 214.67□□□□□ -0.065e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 UBE2N-203ENST00000549490 676 ntTSL 211.18□□□□□ -0.625e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 UBE2N-206ENST00000552442 607 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.675e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.125e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.225e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 UCA1-202ENST00000589333 433 ntTSL 37.25□□□□□ -1.255e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 UCA1-203ENST00000600160 436 ntTSL 26.42□□□□□ -1.385e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.65e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 34.77□□□□□ -1.655e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 EIF2AK1-209ENST00000490523 905 ntTSL 29.45□□□□□ -0.96e-18■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 CALR-203ENST00000586803 667 ntTSL 216■□□□□ 0.153e-22■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 226.65■■□□□ 1.861e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.141e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.84e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.331e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.31e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 315.66■□□□□ 0.11e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 215.45■□□□□ 0.061e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 315.41■□□□□ 0.061e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -01e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.733e-18■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 CNOT2-203ENST00000546673 726 ntTSL 33.59□□□□□ -1.833e-18■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ATP6V1B2-204ENST00000521442 738 ntTSL 39.84□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ATP6V1B2-206ENST00000523482 6907 ntTSL 26.76□□□□□ -1.334e-6■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.341e-8■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.761e-8■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.981e-8■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 LTBP4-225ENST00000599225 281 ntTSL 319.64■□□□□ 0.735e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-205ENST00000531596 968 ntTSL 325.37■■□□□ 1.655e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ACP1-208ENST00000442386 546 ntTSL 423.39■■□□□ 1.335e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.35e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 COPS6-203ENST00000419210 218 ntTSL 322.55■■□□□ 1.25e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-204ENST00000530192 576 ntTSL 221.34■■□□□ 1.015e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.975e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-206ENST00000533698 710 ntTSL 320.61■□□□□ 0.895e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-207ENST00000534482 913 ntTSL 320.35■□□□□ 0.855e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ACP1-209ENST00000453390 577 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.325e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 CLPTM1L-204ENST00000503534 742 ntTSL 212.24□□□□□ -0.455e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ACP1-213ENST00000484464 573 ntTSL 410.21□□□□□ -0.775e-12■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 CCNB1-202ENST00000503507 750 ntTSL 518.47■□□□□ 0.552e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-213ENST00000509582 716 ntTSL 311.39□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 CCNB1-206ENST00000508407 780 ntTSL 28.8□□□□□ -12e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.092e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-212ENST00000505321 552 ntTSL 57.1□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.472e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-203ENST00000354702 569 ntTSL 55.24□□□□□ -1.572e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.732e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PTP4A2-206ENST00000489313 1551 ntTSL 213.33□□□□□ -0.288e-10■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.828e-10■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PTP4A2-217ENST00000602683 667 ntTSL 26.45□□□□□ -1.388e-10■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.698e-10■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.275e-24■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 POLE3-204ENST00000479871 2396 ntTSL 215.75■□□□□ 0.114e-11■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-11■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-11■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 320.24■□□□□ 0.835e-85■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 217.66■□□□□ 0.425e-85■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 HNRNPH1-246ENST00000523449 793 ntTSL 316.02■□□□□ 0.165e-85■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.752e-21■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 MAD2L1-202ENST00000333047 1277 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.667e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.462e-21■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.047e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PPA1-201ENST00000373230 787 ntTSL 58.38□□□□□ -1.072e-21■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PPA1-204ENST00000495346 282 ntTSL 33.47□□□□□ -1.852e-21■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.525e-32■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 213.77□□□□□ -0.215e-32■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.114e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.014e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.184e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.284e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-208ENST00000563275 699 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.028e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 03e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-8■□□□□ 8.6
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