Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTK7Q13308 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTK7Q13308 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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