Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CALCOCO2Q13137 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CALCOCO2Q13137 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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