Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BPTFQ12830 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BPTFQ12830 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BPTFQ12830 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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