Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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KCNMA1Q12791 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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KCNMA1Q12791 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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KCNMA1Q12791 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCNMA1Q12791 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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KCNMA1Q12791 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNMA1Q12791 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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