Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms