Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL9Q07325 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL9Q07325 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms