Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNDQ07001 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms