Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BNC1Q01954 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms