Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OTUD4Q01804 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms