Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UBE2NP61088 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms