Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP53609 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms